药研生物技术服务
计算机辅助药物设计平台

计算机辅助药物设计致力于应用各类计算机模拟技术来加速药物发现和设计进程,与化学和生物实验结合,更高效地推进药物开发项目进程。其以物理学、结构化学、药物化学、生物化学、分子生物学等学科为基础,以量子化学、分子力学等为理论依据,借助计算机数值计算和逻辑判断、数据库、图形学、人工智能等处理技术,展开基于结构的药物设计。

  1. 计算化学技术
     

    计算化学技术主要为化学小分子药物设计提供计算指导和帮助。从靶标分析、高通量筛选分析、苗头化合物发现、先导化合物发现、先导化合物优化到成药性预测,计算化学均可以提供相应的模拟分析。团队由多位拥有制药经验的计算化学家组成,采用各类先进计算化学工具,完成化合物的设计筛选优化一站式服务。

     

    Potential binding site prediction:

     

     

     

    Virtual screening流程:

     

     

    Shape Screening/Pharmacophore models:

     

     

     

    Fragment Linking and Evolution:

     

    Library enumeration:

     

    ADMET Predictions:

     

     

    Molecular Dynamics (MD) and Monte Carlo (MC) Simulation:

     

     

    Free Energy Perturbation (FEP) Calculations:

     

  2. 计算生物学技术
     

    计算生物学技术主要为生物大分子药物设计,如多肽、蛋白药物、核酸药物和抗体,提供计算指导和帮助。以结构为基础,计算工具可以为大分子与靶标之间的结合进行预测,并帮助设计改造大分子药物。针对抗体药物,计算工具可以服务于抗体人源化、亲和力成熟、性质预测等,大大降低传统实验室中抗体设计的成本并缩短研发时间。

     

    Antibody humanization workflow:

     

    Affinity maturation:

     

    Software:

技术与平台