PROTAC药物研发服务

澳门威斯人手机官网凭借世界领先的基于结构的药物研发技术优势,为全球客户提供覆盖生物、化学的全方位的PROTAC药物研发服务,包括蛋白制备与晶体结构研究、PROTAC分子高通量筛选、动力学研究、药物代谢、药物化学、Bioassay、CADD等服务。

  • 50+
    研究E3连接酶
  • ~80
    交付靶蛋白-PROTAC-E3连接酶三元复合结构
计算机辅助PROTAC分子设计
随着理论模型准确性的提高,CADD对PROTAC设计的重要性日益凸显。它能在相对较短的时间内筛选出针对特定target和E3 ligase的最有潜力的PROTAC分子,为实验工作者节约大量的测试时间和资金成本。澳门威斯人7026com计算机辅助药物设计(CADD)平台在PROTAC分子设计方面采用新策略,将文献报道中CADD设计PROTAC分子的策略与澳门威斯人7026com自有的增强分子动力学采样技术相结合,进一步提高计算结果的准确性,以帮助设计优化PROTAC分子,从而提高PROTAC分子设计的成功率。
基于CADD的PROTAC设计主要包含以下步骤:

 

我们通过基于结构的配体设计得到warhead和E3 ligand,然后再通过分析得出target protein与warhead的binding mode,最终确定linker与warhead的可能结合点位和方式。(通常情况下,target protein结构已知,而E3 ligase我们一般会考虑文献中报道过的结构。)

 

linker与E3 ligand的结合点位和方式通过同样的方式也可以获得。我们从文献中报道过的常见linker类型中,各选出若干最有代表性的linker化合物,从中筛选出能生成稳定warhead-linker-ligand组合(即PROTAC分子)的linker,接着再挑选出能得到target-PROTAC-ligase ternary complex稳定构象的PROTAC。我们将其作为备选分子,以开展进一步的实验验证。

 

针对target-PROTAC-ligase ternary complex的构象分析,澳门威斯人7026com可以采用不同的策略,例如采用先研究target-PROTAC,再研究target-PROTAC-ligase的策略,或者直接研究target-PROTAC-ligase。

 

In-Silico PROTAC Design流程:

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